Durante el 2016, el Hospital Nacional Hipólito Unanue incorporó transferencias financieras FISSAL por S/.1,693,042.00, de los cuales, S/.1,589,526.00 fueron para la cobertura de enfermedades oncológicas bajo el programa presupuestal de Prevención y Control de Cáncer, mientras que S/.103,516.00 fue asignado para insuficiencia Renal Crónica, del cual, el 97.7% corresponde a prestaciones nominadas prospectivas.
Asimismo, efectuada la revisión de los gastos que se realizaron en el periodo 2016 se destinó en el componente de reposición el importe total de S/1´452,735.15 que equivale al 100% de los devengados totales, siendo los gastos únicamente en material, insumos e instrumental médico quirúrgico, odontológico y medicamentos.